Codon usage in E.coli genes REFERENCE: Modified from Maloy, S., V. Stewart, and R. Taylor. 1996. Genetic analysis of pathogenic bacteria. Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY. 학술관련/gene cloning 2008.07.02
PCR PCR(polymer chain reaction)은 DNA의 원하는 부분을 증폭하는 방법이다. DNA molecule의 어느 부분이든지 그 border sequence만 알면 이 방법을 통해서 증폭할 수 있다. PCR은 기본적으로 denaturation, annealing, extension의 세 단계로 구성되어 있고, 이 과정이 반복되면서 DNA가 증폭된다. 기본적으로 PCR을 구성하고 있는 요소.. 학술관련/gene cloning 2008.02.19
Primer design 유의점 출처 : http://bioinfo.sarang.net/wiki/PrimerDesign PrimerDesign Primer Design. PCR을 통해 특정서열을 증폭해내고자 할때, 원하는 서열을 콕 집어내려면, 서열을 보고 적절한 primer를 디자인해야한다. 약 18-24mer의 oligomer서열과 Tm값을 계산해낼 수 있다. annealing온도의 몇도차이가, 현저한 PCR결과를 만들어낸다. 20base이내.. 학술관련/gene cloning 2008.02.19
Ligation 후 Transformation하기 Ligation 후 Transformation하기 1. Beed와 selective plate를 37℃에 incuvation. - ligation 되기를 기다리는 동안 냉장보관 해 둔 plate에 veed를 20~25개 정도 넣어서 37℃ incuvator에 미리 데워둔다. - selective plate : 우리가 사용하고자 하는 vector가 가진 restriction gene이 배양시 발현 될 것이기에, 이 항생제가 포함된 배지를 이.. 학술관련/gene cloning 2008.02.19
Ligation Kit을 이용한 DNA Ligation Ligation Kit을 이용한 DNA Ligation 실제 우리 실험실에서는 빠른 시간내에 DNA ligation을 하기위해서 DNA ligation kit을 이용한다. * KIT 조성 (TaKaRa) ┏ solutionⅠ : 효소액 ┣ solutionⅡ : 연결 완충 용액 ┗ solutionⅢ : Transformation Enhancer ⇒ circular DNA를 생성하는 ligation 반응 후에 competent cell 내부로의 transformation 전에 li.. 학술관련/gene cloning 2008.02.19